Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc178Q8CDV0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc178Q8CDV0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc178Q8CDV0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc178Q8CDV0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms