Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfrp1Q8C4U3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfrp1Q8C4U3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sfrp1Q8C4U3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfrp1Q8C4U3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms