Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg16l1Q8C0J2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg16l1Q8C0J2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg16l1Q8C0J2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms