Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam53cQ8BXQ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam53cQ8BXQ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam53cQ8BXQ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam53cQ8BXQ8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam53cQ8BXQ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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