Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctdsp2Q8BX07 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctdsp2Q8BX07 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctdsp2Q8BX07 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp2Q8BX07 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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