Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW4

Larp4, La-related protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp4Q8BWW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Larp4Q8BWW4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Larp4Q8BWW4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp4Q8BWW4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp4Q8BWW4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp4Q8BWW4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp4Q8BWW4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms