Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx17Q8BVL3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx17Q8BVL3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx17Q8BVL3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx17Q8BVL3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
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