Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik4Q8BMF5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik4Q8BMF5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik4Q8BMF5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik4Q8BMF5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik4Q8BMF5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms