Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX3

Lrtm2, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm2Q8BGX3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrtm2Q8BGX3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrtm2Q8BGX3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrtm2Q8BGX3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrtm2Q8BGX3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrtm2Q8BGX3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrtm2Q8BGX3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrtm2Q8BGX3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrtm2Q8BGX3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrtm2Q8BGX3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrtm2Q8BGX3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrtm2Q8BGX3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrtm2Q8BGX3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrtm2Q8BGX3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrtm2Q8BGX3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrtm2Q8BGX3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrtm2Q8BGX3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrtm2Q8BGX3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrtm2Q8BGX3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrtm2Q8BGX3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrtm2Q8BGX3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms