Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnpo1Q8BFY9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnpo1Q8BFY9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnpo1Q8BFY9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnpo1Q8BFY9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.6 ms