Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX3

Kctd3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd3Q8BFX3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Kctd3Q8BFX3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kctd3Q8BFX3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kctd3Q8BFX3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kctd3Q8BFX3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms