Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srrm3Q80WV7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm3Q80WV7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srrm3Q80WV7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms