Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ntf4Q80VU4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ntf4Q80VU4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ntf4Q80VU4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ntf4Q80VU4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ntf4Q80VU4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ntf4Q80VU4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ntf4Q80VU4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ntf4Q80VU4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ntf4Q80VU4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ntf4Q80VU4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ntf4Q80VU4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ntf4Q80VU4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ntf4Q80VU4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ntf4Q80VU4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ntf4Q80VU4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms