Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpf1Q7TND5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpf1Q7TND5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpf1Q7TND5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpf1Q7TND5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms