Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sys1Q78S06 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sys1Q78S06 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms