Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm3bQ6ZPY7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm3bQ6ZPY7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm3bQ6ZPY7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Kdm3bQ6ZPY7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Kdm3bQ6ZPY7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Kdm3bQ6ZPY7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Kdm3bQ6ZPY7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm3bQ6ZPY7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kdm3bQ6ZPY7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm3bQ6ZPY7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm3bQ6ZPY7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms