Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CtifQ6PEE2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CtifQ6PEE2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CtifQ6PEE2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtifQ6PEE2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtifQ6PEE2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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