Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC061212Q6P8K3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BC061212Q6P8K3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC061212Q6P8K3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms