Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rrp12Q6P5B0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrp12Q6P5B0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rrp12Q6P5B0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrp12Q6P5B0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms