Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc66Q6NS45 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc66Q6NS45 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc66Q6NS45 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc66Q6NS45 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc66Q6NS45 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc66Q6NS45 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc66Q6NS45 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc66Q6NS45 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc66Q6NS45 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ccdc66Q6NS45 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc66Q6NS45 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc66Q6NS45 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc66Q6NS45 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms