Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn11Q6J756 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Capn11Q6J756 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capn11Q6J756 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms