Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CilpQ66K08 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CilpQ66K08 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CilpQ66K08 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CilpQ66K08 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CilpQ66K08 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms