Protein–RNA interactions for Protein: Q640M6

Gdpd5, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd5Q640M6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gdpd5Q640M6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gdpd5Q640M6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdpd5Q640M6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms