Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PatjQ63ZW7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PatjQ63ZW7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PatjQ63ZW7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PatjQ63ZW7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms