Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vamp1Q62442 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp1Q62442 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms