Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf6Q62311 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf6Q62311 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf6Q62311 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf6Q62311 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf6Q62311 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf6Q62311 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf6Q62311 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf6Q62311 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf6Q62311 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf6Q62311 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf6Q62311 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf6Q62311 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms