Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six1Q62231 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six1Q62231 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Six1Q62231 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six1Q62231 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six1Q62231 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six1Q62231 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six1Q62231 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six1Q62231 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six1Q62231 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six1Q62231 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six1Q62231 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Six1Q62231 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Six1Q62231 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Six1Q62231 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six1Q62231 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six1Q62231 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms