Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tgfb1i1Q62219 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tgfb1i1Q62219 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Tgfb1i1Q62219 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tgfb1i1Q62219 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tgfb1i1Q62219 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tgfb1i1Q62219 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tgfb1i1Q62219 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tgfb1i1Q62219 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tgfb1i1Q62219 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tgfb1i1Q62219 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tgfb1i1Q62219 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tgfb1i1Q62219 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms