Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trim27Q62158 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim27Q62158 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim27Q62158 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim27Q62158 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms