Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkd1Q62101 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prkd1Q62101 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prkd1Q62101 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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