Protein–RNA interactions for Protein: Q61851

Fgfr3, Fibroblast growth factor receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr3Q61851 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr3Q61851 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr3Q61851 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr3Q61851 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr3Q61851 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr3Q61851 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr3Q61851 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr3Q61851 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgfr3Q61851 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgfr3Q61851 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgfr3Q61851 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgfr3Q61851 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgfr3Q61851 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fgfr3Q61851 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fgfr3Q61851 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgfr3Q61851 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms