Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AlcamQ61490 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AlcamQ61490 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AlcamQ61490 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AlcamQ61490 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AlcamQ61490 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms