Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pde3bQ61409 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pde3bQ61409 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms