Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Meis1Q60954 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Meis1Q60954 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Meis1Q60954 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Meis1Q60954 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Meis1Q60954 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms