Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cdkn2dQ60773 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdkn2dQ60773 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdkn2dQ60773 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms