Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyfip2Q5SQX6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cyfip2Q5SQX6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyfip2Q5SQX6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms