Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp36l3Q5ISE2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp36l3Q5ISE2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp36l3Q5ISE2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp36l3Q5ISE2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp36l3Q5ISE2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp36l3Q5ISE2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp36l3Q5ISE2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp36l3Q5ISE2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp36l3Q5ISE2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp36l3Q5ISE2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Zfp36l3Q5ISE2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp36l3Q5ISE2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp36l3Q5ISE2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp36l3Q5ISE2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp36l3Q5ISE2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp36l3Q5ISE2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp36l3Q5ISE2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp36l3Q5ISE2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp36l3Q5ISE2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp36l3Q5ISE2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp36l3Q5ISE2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp36l3Q5ISE2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms