Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc8bQ5DU41 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8bQ5DU41 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc8bQ5DU41 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms