Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CenpjQ569L8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CenpjQ569L8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CenpjQ569L8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CenpjQ569L8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CenpjQ569L8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CenpjQ569L8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CenpjQ569L8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CenpjQ569L8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms