Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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