Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B230104I21RikQ3USW4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
B230104I21RikQ3USW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B230104I21RikQ3USW4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms