Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UST5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UST5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UST5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UST5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UST5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UST5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UST5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UST5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UST5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UST5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UST5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UST5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3UST5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3UST5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3UST5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3UST5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3UST5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3UST5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3UST5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3UST5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3UST5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3UST5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3UST5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3UST5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3UST5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3UST5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3UST5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UST5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UST5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UST5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UST5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UST5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UST5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3UST5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Q3UST5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3UST5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3UST5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3UST5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UST5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UST5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UST5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UST5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UST5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UST5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UST5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UST5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UST5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UST5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UST5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UST5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UST5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UST5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UST5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UST5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UST5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UST5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UST5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UST5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UST5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UST5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UST5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UST5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UST5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UST5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UST5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UST5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UST5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q3UST5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UST5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UST5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UST5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UST5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UST5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UST5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q3UST5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UST5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UST5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UST5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UST5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UST5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UST5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UST5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UST5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UST5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UST5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UST5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UST5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UST5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UST5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UST5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UST5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UST5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UST5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UST5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UST5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UST5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UST5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UST5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q3UST5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms