Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms