Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Edc4Q3UJB9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Edc4Q3UJB9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Edc4Q3UJB9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Edc4Q3UJB9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Edc4Q3UJB9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Edc4Q3UJB9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Edc4Q3UJB9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Edc4Q3UJB9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Edc4Q3UJB9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Edc4Q3UJB9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Edc4Q3UJB9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Edc4Q3UJB9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms