Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rrp36Q3UFY0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp36Q3UFY0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp36Q3UFY0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp36Q3UFY0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms