Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pag1Q3U1F9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pag1Q3U1F9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pag1Q3U1F9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms