Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hace1Q3U0D9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hace1Q3U0D9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hace1Q3U0D9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hace1Q3U0D9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms