Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmtk2Q3TYD6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lmtk2Q3TYD6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lmtk2Q3TYD6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lmtk2Q3TYD6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Lmtk2Q3TYD6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lmtk2Q3TYD6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmtk2Q3TYD6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmtk2Q3TYD6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmtk2Q3TYD6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmtk2Q3TYD6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmtk2Q3TYD6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmtk2Q3TYD6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmtk2Q3TYD6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmtk2Q3TYD6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmtk2Q3TYD6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Lmtk2Q3TYD6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms