Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21440Q3TTD8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm21440Q3TTD8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21440Q3TTD8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms