Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Calr4Q3TQS0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Calr4Q3TQS0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Calr4Q3TQS0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Calr4Q3TQS0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.4 ms